苏州注册公司在网上的操作流程如下：

1. 用户注册登录：访问江苏省政务服务网，点击右上角 “注册”，选择 “法人注册”，填写相关信息完成注册，如法人类型、法人名称、统一信用代码、法定代表人姓名、证件类型及号码等，也可选择电子营业执照注册。注册成功后，登录系统。

2. 名称自主申报：在 “江苏省政务服务网” 首页进入 “企业全链通服务专题”，点击 “开办专区”，进入 “江苏省企业全链通综合服务平台”，将右上角定位切换到 “苏州”，点击 “新设名称申报”，填写名称信息，包括行政区划、字号、行业关键字、组织形式等，完成名称自主申报。

3. 设立信息填写：名称申报成功后，返回 “江苏省企业全链通综合服务平台”，点击 “我要开办”，输入名称自主申报号，进入设立信息填写页面，依次填写公司的基本信息，如住所、注册资本、经营范围、股东信息、法定代表人、监事、财务负责人等信息，并上传法定代表人、经办人、监事、股东、董事、高级管理人员等身份证正、反面。

4. 住所核验：若住所信息通过产权核验，可仅提交市场主体住所（经营场所）使用（信息申报）承诺书，法人手写承诺并签字上传；若未通过产权核验，则需上传权属证明和租赁协议等住所使用证明材料。

5. 电子签名：信息填写完成且确认无误后，选择电子签名方式，相关人员可通过微信或支付宝 “电子营业执照” 小程序进行签名。

6. 提交审核：完成电子签名后，提交申请材料，等待登记辅导和审核。审核通过后，企业可选择邮寄或到指定地点领取营业执照。